Mamalya:
* Elepante: Matatagpuan sa ilang mga bansa sa Timog-Silangang Asya, kabilang ang Thailand, Malaysia, at Indonesia.
* Tigre: Ang mga tigre ay matatagpuan sa mga kagubatan ng Timog-Silangang Asya, mula sa India hanggang sa Indonesia.
* Unggoy: Maraming uri ng unggoy ang matatagpuan sa rehiyon, mula sa maliliit na macaques hanggang sa mga malalaking orangutans.
* Bison: Ang mga kalabaw ng tubig ay matatagpuan sa mga latian at ilog ng Timog-Silangang Asya.
* Leopard: Matatagpuan sa mga kagubatan ng Timog-Silangang Asya, mula sa India hanggang sa Indonesia.
* Gibbon: Ang mga unggoy na ito ay kilala sa kanilang mahabang braso at kakayahan sa pag-swing mula sa puno patungo sa puno.
Ibon:
* Paru-paro: Ang Timog-Silangang Asya ay tahanan ng iba't ibang uri ng mga paru-paro, kabilang ang mga paruparong Morpho at Birdwing.
* Manok: Maraming uri ng manok ang matatagpuan sa rehiyon, kabilang ang mga manok ng gubat at mga manok ng bahay.
* Ibon ng Paraiso: Ang mga ibon na ito ay matatagpuan sa mga kagubatan ng Papua New Guinea at Indonesia.
* Itik: Ang mga itik ay matatagpuan sa mga lawa, ilog, at mga baybayin ng Timog-Silangang Asya.
Reptilya:
* Ahas: Ang Timog-Silangang Asya ay tahanan ng iba't ibang uri ng mga ahas, kabilang ang mga ahas ng gubat, mga ahas ng dagat, at mga ahas ng bahay.
* Buwaya: Ang mga buwaya ay matatagpuan sa mga ilog at lawa ng Timog-Silangang Asya.
* Pagong: Ang mga pagong ay matatagpuan sa mga dagat at ilog ng Timog-Silangang Asya.
Iba pa:
* Kulisap: Ang Timog-Silangang Asya ay tahanan ng iba't ibang uri ng mga kulisap, kabilang ang mga langgam, bubuyog, at mga tutubi.
* Isda: Ang mga ilog, lawa, at dagat ng Timog-Silangang Asya ay tahanan ng iba't ibang uri ng mga isda, kabilang ang mga tuna, sardinas, at mga marlin.
Ito ay ilang halimbawa lamang ng mga hayop na matatagpuan sa Timog-Silangang Asya. Ang rehiyon ay tahanan ng maraming iba pang mga hayop, mula sa mga mammals, birds, reptiles, amphibians, hanggang sa mga invertebrates.